南阳市中医院（独山院区）是集医疗、教学、科研、康复、保健于一体的国家三级甲等中医院，与中国中医科学院望京医院共建国家中医（骨伤）区域医疗中心，是国家中医药管理局命名的“国家中药炮制技术传承基地”、国家中医住院医师规范化培训基地、河南省区域中医儿科诊疗中心。

医院现有职工1550人，开放床位2000张；设立有国医大师唐祖宣工作室、石学敏院士工作室、孙树椿名医工作室；国家中医药管理局张仲景经方传承与应用重点研究室、河南省张仲景经方智能化开发工程技术研究中心、南阳市张仲景经方复杂作用解析重点实验室、南阳市中医骨伤生物力学重点实验室、两个国家中医优势专科（骨伤、康复）项目均已获批建设；医院正积极谋划河南省重点实验室张仲景实验室建设。

现有规模为一院四区：七一院区、独山院区、新华院区、新店院区；其中新店院区一期占地196亩，规划床位1500张，预计2024年9月建成投入使用。

七一院区设置床位800张。开设28个优势病区，30多个特色专科。内设“南阳市中西医结合儿童医院”“南阳市中毒诊疗中心”“南阳市微创外科（腔镜）治疗中心”“南阳市肾病透析中心”等，拥有儿科、老年病科2个国家级重点专科，骨伤科、儿科、肿瘤科3个省级重点专科，心血管科、肛肠科、针推科3个市级特色专科；有高惠然、王心东、赵青春、孙树椿4个国家名老中医专家传承工作室，全国优秀中医临床人才4 人，河南省学术技术带头人1人，南阳市名中医17人。拥有64排X射线计算机体层摄影设备、1.5T磁共振、O型臂是国内最先进的数字导航系统、平板血管造影机、乳腺X射线机、飞利浦彩色超声多普勒、X射线诊断设备、数字胃肠机、全自动生化仪、多功能麻醉机、麻醉监测系统、关节镜系统、椎间孔镜、高清内窥镜系统、医用制氧机、多参数康复疼痛治疗仪、放射线机、标准化实验室、PCR实验室等大型设备，能够保障医院现有业务需求。

独山院区（南阳市中医院骨伤医院，原南阳市骨科医院）开放床位1000张，是南阳市骨科的医疗、康复、科研和教学中心、南阳市骨科质控中心，是南阳市骨科联盟组织和实施单位，南阳市骨科医师协会会长单位。自2022年7月以来与中国中医科学院望京医院紧密合作，项目建设取得丰硕成果，医疗资源实现“管理、技术、品牌”三平移。开展新业务、新技术61 项，非药物中医治疗项目 90余项；建成六大中心（脊柱脊髓病中心、关节病中心、创伤骨科中心、运动医学中心、疼痛康复中心、非药物治疗中心）和4个优势专科（足踝外科、小儿骨科、显微手外科、骨感染科），细化分为27个临床亚专业科室；其中足踝科、关节二科为河南省中医重点专科。创建中医护理门诊、急诊创伤中心、治未病中心、市级重点实验室两个：南阳市张仲景经方复杂作用解析重点实验室、南阳市中医骨伤生物力学重点实验室。

新华院区（南阳市中医院康复医院）开放床位200张。共设11个临床科室：6个疼痛康复科（3个分设在七一院区）、1个运动康复科、6个骨伤科。成立了中国工程院院士石学敏国医大师工作站，中国针灸学会，河南省针灸协会南阳专家工作站，是河南省疼痛康复医学专科联盟单位，在康复和骨伤领域具有丰富的临床经验。

新店院区（南阳市中医院新院区），位于市城乡一体化示范区（菱新路以东、规划黄河大道西侧、规划康泰路以北区域），项目总用地面积约196亩，设计床位1500张。2024年8月，项目竣工验收，届时将建成一个美丽、绿色的“花园式医院”，为南阳广大市民和周边市县群众提供更为优质、便捷、舒适的医疗服务。